Integración Linux/Windows - Parte I.

Buenas, volvi pronto.
Resulta que stoy trabajando en la integracion de sistemas de seguridad Linux a MS Windows. El problema es el siguiente:
Se posee un sitema de monitoreo que debe emular la accion de un usuario al intentar validarse via certificado contra un IAS (El cual se conecta contra un Active Directory Server).

Todo empezó bastante bien, es más creía que iba a funcionar sin pensar demasiado. Lamentablemente no es asi. El problema radica en que el equipo que posee el soft de monitoreo es un Linux, y bien, ¿que tiene eso de malo?... nada, pero todo en realidad. Al trabajar sobre una estructura PKI basada en AD de Windows, el equipo deberia estar dentro del dominio, y como se pueden dar cuenta no es el caso, pero.. ¿que implica eso?
En principio implica que el certificado que le voy asignar (el cual debe estar definido como valido tanto en el IAS como en el AD) es un certificado para maquinas windows, y la PC al no estar en dominio no lo podra "enrolar" adecuadamente, resultando en un trabajo en vano y fallido.
Aún no encuentro la solucion a este problema de integracion Linux / Windows, pero en cuanto tenga alguna novedad se las hare saber.

Slds.,